La tredicesima stagione della serie televisiva NCIS - Unità anticrimine (13), composta da 24 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 22 Settembre 2015 al 17 Maggio 2016. Disponibile in Italia dal 31 Gennaio 2016 al 13 Novembre 2016.
Gibbs sta lottando per la sua vita dopo essere stato ferito da Luke Harris. Intanto DiNozzo e l'Agente della CIA Joanna Teague si recano in Egitto per risolvere il caso.
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Gibbs chiede al team di lavorare a un caso con un Agente della DEA per arrestare un trafficante di droga connesso al passato di Gibbs e dell'Agente.
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Gibbs riceve una chiamata per un possibile caso da un Marine che viene ritrovato morto dopo poche ore a Quantico. McGee e Bishop stanno lavorando sotto copertura fingendosi una coppia.
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Vance lavora in coppia con Gibbs sul campo per un caso di omicidio connesso a un ex Agente NCIS che Vance fece arrestare per il furto di prove.
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Durante un'indagine, Abby rimane intrappolata in un laboratorio farmaceutico preso d'assalto da uomini armati che hanno preso degli ostaggi.
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Il team indaga sulla morte di un guardiamarina i cui dettagli assomigliano ai metodi di uccisione di un serial killer. Delilah e McGee intanto decidono di andare a vivere insieme.
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L'NCIS indaga sulla morte di un ufficiale di marina in pensione il cui figlio si trova in prigione da sedici anni per una condanna di omicidio. Un test di laboratorio prodotto all'epoca potrebbe aver dato risultati errati...
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DiNozzo deve vedersela con il ritorno di una donna del suo passato, Jeanne Benoit, quando la donna gli si rivolge per avere aiuto in merito alla scomparsa di suo marito, avvenuta durante un attacco di ribelli in Sudan. Tony e McGee si recano sul posto per indagare sulla situazione, che comprende un omicidio e il rapimento dei dottori.
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Un sottufficiale, accusato di aver ucciso la sua ex ragazza, viene liberato a causa di un cavillo legale. Professando la sua innocenza, chiede al team di indagare e se necessario, di metterlo davanti alla Corte Marziale.
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Il Segretario della Difesa si rivolge all'NCIS per aiutare un marinaio che sta morendo di leucemia; serve un donatore, ma i suoi due fratelli sono morti mentre erano in servizio. Bishop decide di tornare in Oklahoma dopo aver scoperto del tradimento di Jake.
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Ducky viene aggredito da un uomo che dichiara di avere informazioni su suo fratello, morto molti anni fa. Il team si mette alla ricerca dell'aggressore, mentre Ducky ricorda gli ultimi, tristi, giorni che ha trascorso con suo fratello. Bishop e Jake discutono del futuro della loro relazione.
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Gibbs e il team lavorano con Pride e il team di New Orleans per cercare il fratello di Abby per scoprire come mai l'equipaggio e i passeggeri dell'aereo su cui lavorava sono stati avvelenati.
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Le indagini sull'omicidio di un marinaio portano alla luce un traffico di schiavi. McGee spera di poter trascorrere la notte con una collega durante un black-out.
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Il team indaga sull'omicidio di un sommozzatore specializzato in grandi profondità, ritrovato morto in una camera di decompressione, dove la vittima e i sospettati dovranno rimanere per quattro giorni.
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Il team lavora fianco a fianco con l'FBI per salvare la figlia di Sarah Porter rapita da persone sconosciute.
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Il Dottor Cyril Taft collabora con il team dell'NCIS quando è chiamato a operare su un sospettato per scoprire delle prove cruciali.
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I piani per il tempo libero degli agenti sono interrotti quando ognuno di loro incontra degli errori in un caso apparentemente molto semplice. McGee e Delilah discutono sull'importanza di non parlare di lavoro durante la cena mentre DiNozzo annoia a morte una ragazza con cui è uscito.
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Gibbs cerca di trovare terreno comune con un tiratore scelto delle Forze Speciali rimasto ferito dopo che una coppia viene attaccata nello stesso luogo dove il team del tiratore è stato preso d'agguato.
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Un ufficiale degli Affari Pubblici della Marina viene assassinato: la moglie e l'amante si accusano a vicenda e il team deve capire dove si trova la verità.
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L'identità di Tony viene rubata da un gruppo di persone che mettono in atto un ricatto contro un Senatore.
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Una famiglia proprietaria di un'impresa di onoranze funebri ordina una serie di bare da una compagnia oltreoceano; quando vanno a ritirare il carico scoprono che una delle bare è già occupata da un cadavere. Durante le indagini si scopre un collegamento con un'evasione carceraria di un individuo che NCIS ha fatto incriminare.
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Gibbs e il resto del team indagano su un'effrazione in una casa di proprietà di militari che è stata fermata da un quattordicenne. Vance e Fornell si recano a Londra per seguire le tracce della spia scappata.
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Il team continua a lavorare al caso della spia internazionale scappata, mentre un collega combatte per la propria vita in sala di rianimazione.
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L'NCIS, l'FBI e l'MI6 continuano a dare la caccia alla spia inglese che sta prendendo di mira agenti ed ex agenti per eliminarli. Tony fa una scoperta scioccante che lo metterà di fronte a una decisione fondamentale per il suo futuro.
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