La terza stagione della serie televisiva In Plain Sight - Protezione testimoni (3), composta da 13 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 31 Marzo 2010 al 30 Giugno 2010.
Mentre Marshall e Mary sono decisi a trovare l'assalitore di lei, Jinx fa pressioni perchè lei lasci il lavoro, temendo per la sua sicurezza. Stan è deciso a confessare a Mary i suoi sentimenti dopo aver rischiato di perderla.
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Un'intrusione minaccia la sicurezza del primo testimone che Mary e Marshall hanno protetto insieme. Una serie di flashback ci mostra il loro primo incontro.
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Dopo essere stato in coma per tre anni, un agente dell'ATF si risveglia e scopre di essere stato inserito nel programma di protezione in seguito al tentativo di omicidio subito da parte di un trafficante d'armi.
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Un informatore dell'FBI che rifiuta di essere inserito nel programma si mette nei guai. Stan lavora con un testimone che soffre di demenza derivante dall'attività pugilistica.
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Dominic, un testimone di Mary che aveva una passione sconfinata per gli esplosivi, s'innamora per la prima volta in vita sua, ma quando le cose non vanno come previsto, Mary deve fermarlo dal ricadere nelle vecchie abitudini.
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Mary riceve l'incarico di fare da 'guida' a un detenuto uscito sulla parola dopo 38 anni di detenzione, in modo che possa ambientarsi al mondo esterno.
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L'agente dell'FBI Mike Faber, torna con un nuovo testimone per Mary, un truffatore, ma in realtà Mike ha altri scopi per questa visita...
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Marshall è convinto che suo padre, anch'egli uno sceriffo federale, sia in città per valutare il suo lavoro. Brandi finalmente torna a casa, portandosi dietro un ospite.
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Mary fa amicizia con una donna che sta aspettando l'approvazione per entrare nel programma di protezione dopo essere scappata dalla sua famiglia, noti esponenti della criminalità organizzata. Intanto la madre di Mary fa la conoscenza di Scott.
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Una testimone che soffre di una forma di autismo, si rifiuta di testimoniare contro la sua unica amica, suscitando la frustrazione di Mary. Marshall e Stan cercano di impedire lo spostamento di un testimone chiave, mentre Brandi racconta a Mary dei suoi piani per il futuro.
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Mary da una mano al suo testimone, un senzatetto che fa fatica ad adattarsi alla sua nuova vita e che è alla ricerca della sua madre naturale. Nel frattempo la richiesta di Scott per ulteriori somme di danaro preoccupa Brandi.
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Mary tiene d'occhio una giovane testimone, i cui genitori sono talmente presi dai loro problemi da non prestare attenzione alla figlia. Brandi si occupa di Scott dopo che è stato aggredito.
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Un prete assiste all'omicidio di una ragazza per mano di suo padre e entra nel programma di protezione testimoni abbandonando la veste clericale. Brandi e Peter decidono di vivere insieme.
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