La sesta stagione della serie televisiva Rizzoli & Isles (6), composta da 18 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 16 Giugno 2015 al 15 Marzo 2016. Disponibile in Italia dal 4 Febbraio 2016 al 2 Giugno 2016.
Note:La serie è stata rinnovata per una sesta stagione di 18 episodi.
Durante un'inseguimento nella stazione della metro, Frankie uccide accidentalmente un uomo disarmato, un fatto che innesca subito un'indagine degli Affari Interni. Maura da' il benvenuto a Kent Drake, un nuovo apprendista che ha servito in Afghanistan.
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Il team sta indagando sulla morte di un pescatore avvenuta durante un torneo di pesca. Durante le indagini Jane attira le attenzioni di una persona che tenta di far colpo su di lei.
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Alla "fabbrica dei corpi" del BCU (un luogo dove si tengono ricerche sulla decomposizione dei cadaveri ed altri quesiti di ordine forense) è rinvenuta una coppia di sposi spariti da un anno. Il team indaga sulla possibilità che la donna sia stata fatta prigioniera prima della sua morte.
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Jane e Maura si recano al Boston Museum dopo aver ritrovato della pittura sul corpo di un uomo congelato.
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La morte di una persona amica porta il team a indagare su casi trascorsi su cui tutti hanno lavorato.
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Elliot Dutton è il testimone di un omicidio, ma non riesce a identificare l'assassino perchè affetto da prosopagnosia, una malattia del sistema nervoso che impedisce di riconoscere i tratti del volto delle persone. Intanto i Rizzoli ricevono la visita del cugino di Angela, Carlo.
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Una donna scopre un giovane corpo in una gabbia mentre è in giro a fare jogging. Il team teme si tratti delle prime avvisaglie di un serial killer.
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Il padre di Maura, con cui ha perso i contatti, si rifà vivo e questo fatto potrebbe essere collegato all'omicidio di un gioielliere molto noto nell'ambiente dello star system.
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Uno studente universitario viene ucciso e Jane e Maura scoprono che il ragazzo aveva una fiorente vita online come fidanzato a distanza di 32 donne.
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Una donna viene ritrovata morta nella piscina di casa e si sospetta che il cane di famiglia, un Rottweiler sia il colpevole. Dopo che gli esami portano alla luce tracce di veleno, si sospetta delle due figlie.
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Jane e Maura si recano a L.A. per indagare su due casi di omicidio: una vittima di Los Angeles e una di Boston che hanno nomi e impronte digitali simili.
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Maura trova l'orologio di Jane, settato alle ore 5:26, all'interno del corpo di una vittima di omicidio. Korsak decide di sospenderla temporaneamente dal servizio e mentre il dipartimento indaga sull'omicidio, lei cerca di capire il senso dell'orario indicato.
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Maura viene rapita e Jane e il suo team fanno tutto il possibile per ritrovarla prima che le venga fatto del male. Durante il suo periodo come ostaggio, Maura scopre una cospirazione che potrebbe mettere in pericolo Jane.
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Una guardia giurata in un negozio di marijuana ferma una rapina ma viene ferita, tuttavia lui uccide uno dei ladri. La polizia ha molte domande sull'accaduto che però rimangono semza risposta. Rizzoli e Isle sono alla ricerca del complice dei rapitori, in seguito Rizzoli continua con i suoi sforzi di proteggere Isle e Angela.
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Jane e Maura indagano sull'omicidio di una donna che faceva parte di un club speciale, il "Club della Paura". Korsack e Nina trovano l'hacker di Jane ma la loro scoperta porta a ulteriori domande. Korsack sta pensando di chiedere a Kiki di sposarlo.
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In seguito a una sparatoria in un quartiere tranquillo, Jane e Maura indagano sulla vittima che è rimasta uccisa e finiscono per addentrarsi nel mondo delle gang dell'Europa dell'est. Maura viene colta da un'influenza mentre si bilancia tra lavoro e vita privata e Angela e Kent le prescrivono una serie di rimedi domestici con effetti sorprendenti.
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La squadra deve lavorare contro il tempo per risolvere un omicidio che ha conseguenze esplosive. Angela fa un passo indietro quando Ron le offre di portarla via per un viaggio all'insegna del romanticismo.
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Un agente governativo viene ucciso nel Maine e l'auto usata per il crimine viene fatta risalire a colui che ha organizzato gli attacchi ai danni di Jane. Il team deve svelare il mistero dell'ossessione di quest'uomo nei confronti di Jane per riuscire a fermarlo una volta per tutte.
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Le due donne contro il crimine arrivano su Premium Crime: dal 4 febbraio 2016 ogni giovedi alle ore 21.00