NCIS - Unità anticrimine - Stagione 3

Dopo l'attacco terroristico, i membri dell'NCIS cercano di superare lo shock per la morte di Kate. Gibbs è determinato a trovare Ari e a cancellarlo per sempre dalla faccia della Terra. Nel frattempo, all'NCIS arriva un nuovo direttore: Jenny Shepard, una donna che in passato ha lavorato come partner di Gibbs e con il quale ha avuto una relazione sentimentale.

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La squadra è ancora destabilizzata dalla morte di Kate e dopo che Ari rapisce Ducky le cose non fanno che peggiorare. Gibbs incarica Tony di seguire Ziva, che sembra avere una strana connessione con Ari. Gibbs si ritrova finalmente a tu per tu con il terrorista e Ziva arriva all'ultimo minuto per offrire il suo aiuto a uno dei due...

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Gibbs viene incaricato di parlare con un criminale che si trova nel braccio della morte per scoprire dove ha sepolto le sue vittime. Purtroppo l'interrogatorio non va come previsto e la squadra decide di risolvere la faccenda con i propri metodi.

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Il corpo di un uomo viene ritrovato in una tomba che risale alla Guerra Civile; la squadra scopre che la vittima, un Sergente, è stata sepolta viva. Durante le indagini, Abby riesce a scoprire l'ultima telefonata fatta dal cellulare della vittima, nel frattempo Gibbs viene informato da Jenny Shepard che Ziva farà parte integrante dell'NCIS.

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Un ufficiale della Marina viene ucciso a colpi di arma da fuoco sull'autostrada e l'NCIS è incaricata delle indagini. Presto la squadra scopre che la vittima conduceva una doppia vita e i sospetti puntano in questa direzione, ma durante le indagini viene ritrovato l'ultimo messaggio inviato dalla vittima in fin di vita che porta il team su una strada completamente diversa.

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L'NCIS è incaricata di indagare su un caso fuori dall'ordinario: la moglie di un Marine è stata uccisa in diretta su webcam mentre si esibiva come spogliarellista per un sito a pagamento. Durante le indagini si scopre che altre due donne sono scomparse e mentre cercano di ritrovarle, la squadra rintraccia il webmaster del sito per interrogarlo.

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Un bambino di sei anni informa l'NCIS che il suo papà è stato rapito e la squadra scopre che l'uomo è un Tenente della Marina che lavora per un progetto segreto chiamato 'Onore' e che è l'unico in grado di accedere al programma. Gibbs e il ragazzino stabiliscono subito un legame mentre Tim e Abby scoprono che qualcuno è riuscito a penetrare le difese di Onore e che i dati sono stati cancellati. Resta da vedere se il Tenente è colpevole o innocente.

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All'NCIS arrivano i corpi di due famigerati killer a pagamento; Tony e Ziva assumono la loro identità e cercano di contattare il mandante dell'omicidio. Mentre i due trascorrono il tempo in un albergo lussuoso, Gibbs scopre che non sono gli unici a essere interessati al caso.

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Tony viene accusato di aver ucciso una donna, il cui corpo è stato ritrovato a Quantico. La squadra da il massimo per provare la sua innocenza, ma tutte le prove raccolte e gli esami di laboratorio sono contro di lui.

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Durante un caso, McGee uccide un uomo che si scopre essere un poliziotto sotto copertura. Jenny è costretta ad avviare un'indagine su Tim e la squadra entra in azione per provare la sua innocenza. Pur di aiutare McGee, Gibbs mette a dura prova la pazienza di Jenny, nel frattempo Tony è turbato dal suo passato.

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Durante le riprese di un reality show ambientato in una base della Marina, una top model muore e l'NCIS è incaricata delle indagini. Si scopre che la vittima era coinvolta con tre uomini, tutti possibili indiziati. Nel frattempo Jenny è seccata dal comportamento di Gibbs che si rifiuta di partecipare a una cerimonia in suo onore.

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Durante le indagini nella zona portuale in cerca di contrabbandieri di armi, Tony e Ziva scompaiono. Abby cerca di rintracciarli grazie al segnale GPS dei loro cellulari, ma nessuno dei due è raggiungibile. Nel frattempo i due sono stati intrappolati in un container e cercano un modo per comunicare con la base.

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Il Comandante di una nave adibita al trasporto di combustibile per le centrali nucleari, viene rapito e l'NCIS è chiamata per gestire il caso. Il team lotta contro il tempo prima che il rapitore scopra l'ubicazione delle barre di comustibile o che il Comandante faccia una brutta fine.

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L'NCIS indaga sull'uccisione delle mogli di due Marines e devono scoprire il colpevole prima che uccida la prossima vittima.

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Durante la perquisizione di un atuorimessa illegale, l'NCIS trova la testa di un marine nascosta in una delle auto. La squadra si mette sulle tracce dell'assassino e ...del resto del corpo.

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Un'ambulanza che stava trasportando i resti di un Marine morto in un incidente d'auto, esplode distruggendo il cadavere. La squadra cerca di scoprire se si è trattato di un incidente o di un evento criminoso. Le analisi di laboratorio provano che il DNA rinvenuto sul luogo dell'esplosione non coincide con quello del Marine morto e durante le indagini si scopre che la famiglia della vittima sta nascondendo un segreto importante.

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Un gruppo di ragazzi trova la medaglietta di riconoscimento di un Marine in un bosco e la squadra è chiamata a indagare. Mentre cercano di scoprire la base dove era distaccato l'uomo, si scopre che insieme al Marine c'era un'altra persona, una donna. Le indagini puntano su una pista inquietante che indica la presenza di un serial killer.

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Un teenager minaccia di farsi saltare in aria e prende in ostaggio una degli studenti di un liceo che si trova su una base di Quantico. Gibbs cerca di fermarlo, ragionando con lui, ma si accorge che il ragazzo non sta agendo di sua iniziativa e che riceve ordini attraverso un auricolare. Mentre Gibbs si trova nell'aula con gli studenti, Tony è al comando delle operazioni.

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Gibbs e gli altri sono chiamati a indagare quando un paio di ragazzi trovano il corpo congelato di un Marine scomparso. Mentre la squadra draga il lago per scoprire eventuali indizi, trova invece i corpi di tre uomini crivellati di pallottole. Durante le autopsie, Ducky e Gibbs scoprono che le tre vittime hanno in comune il tatuaggio di una gang di strada. Resta da scoprire la connessione che c'è tra il Marine e gli altri uomini assassinati.

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Una donna che lavora al Pentagono come crittografa viene ritrovata morta e l'NCIS è incaricata di scoprire se la vittima era o non era una spia, e se la sua morte è dovuta a un suicidio. Mentre la squadra indaga, scopre che la donna non era sola quando è morta e quindi si sospetta che si tratti di un caso di omicidio.

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Mentre sta effettuando delle normali analisi su un caso di omicidio, Abby rimane quasi uccisa e presto diventa chiaro che l'omicidio è servito come strumento per tentare di assassinare la giovane analista. Per fermare l'assassino prima che ci riprovi, la squadra è costretta a indagare sul passato di Abby.

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Un uomo muore mentre si trova in custodia dell'NCIS e le tattiche di Ziva sono messe in discussione. Le cose peggiorano quando il fratello del defunto, ignaro del fatto che il suo consanguineo è rimasto ucciso, rapisce Jenny pretendendo di effettuare uno scambio.

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Mentre sta lavorando a un caso, Gibbs rimane gravemente ferito in un'esplosione e portato in ospedale dove rimane in stato di incoscienza mentre rivive i ricordi più dolorosi del suo passato. Il resto della squadra deve mettere da parte i timori per il capo e lavorare sotto il comando di Tony per assicurare i colpevoli alla giustizia.

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La squadra si occupa di un caso di terrorismo mentre Gibbs è ancora in ospedale. Riavutosi dal coma, si è svegliato con una grave amnesia che riguarda gli ultimi anni della sua vita. Tony, Tim, Ziva e Abby continuano a indagare, ma scoprono che hanno bisogno dell'aiuto di Gibbs che è in possesso di informazioni che riguardano i piani dei terroristi.

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