La prima stagione della serie televisiva Kyle XY (1), composta da 10 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 26 Giugno 2006 al 28 Agosto 2006. Disponibile in Italia.
Un adolescente, trovato nel mezzo del traffico disorientato e senza ricordi del suo passato, viene accolto dalla famiglia Trager. Kyle, questo il suo nome, ha inizialmente difficoltà con entrambi i ragazzi Trager, Josh e Lori, ed infastidisce il padre Stephen, ma uno per volta convince tutti loro ad accettarlo.
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Kyle scopre il concetto di tempo e si chiede perchè tutti si concentrino su esso. Nel tentativo di stancare Kyle, i Trager lo fanno correre, gli somministrano sonniferi e lo sottopongono a varie attività. Josh inizia a sospettare che possa essere un alieno.
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La polizia rinviene uno scheletro vicino al luogo in cui Kyle è stato trovato. Nel frattempo Kyle è confuso dai vari gradi di bugie che le persone si raccontano a vicenda.
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Kyle cerca di capire le sue emozioni e l'improvvisa attrazione che prova per la vicina, Amanda.
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Kyle, Lori e Josh si trovano in difficoltà durante il loro primo giorno di scuola. Intanto Nicole e Stephen ricevono una visita da Tom Foss.
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Kyle è frustrato dai suoi primi ricordi. Intanto è il compleanno di Lori, ma la ragazza non è eccitata al riguardo.
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Kyle collega i suoi ricordi a quelli di un professore scomparso, ma una volta entrato nella squadra di basket, viene distratto da questa nuova esperienza. Nel frattempo, Nicole ottiene una maggior comprensione della situazione unica di Kyle.
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Dopo una inusuale sessione di ipnosi, Kyle è convinto di sbloccare la sua memoria. Accompagna quindi Lori e Declan all'Università di Washington alla ricerca di indizi sul Professor Kern e su come sia collegato a lui.
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Kyle scopre di avere l'abilità di leggere le labbra ed ascoltare conversazioni distanti, così usa la sua nuova capacità per indagare su Tom Foss.
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I Peterson, i veri genitori di Kyle, arrivano per portarlo a casa, ma Kyle è scettico riguardo il loro legame biologico, così si rivolge a Tom Foss per delle risposte. Nel frattempo, Stephen ha problemi ad accettare che Kyle possa lasciarli.
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